SMA N 1 Jakenan memiliki sebuah logo yang menjadi identitas satuan pendidikan. Logo tersebut dibuat dan dipublikasikan secara resmi pada tahun pelajaran 1995-1996. Berikut logo SMA N 1 Jakenan yang mengandung makna :

1. Tulisan  SMA Negeri 1 Jakenan  melambangkan identitas satuan pendidikan , yaitu SMA N 1 Jakenan.
2. Buku dan bolpoin yang berbentuk obor menunjukkan semangat, media dan fasilitas dalam menuntut ilmu pengetahuan.
3. Dua buah bunga mekar warna kuning dengan jumlah cabang yang berbeda :

   1. Bunga mekar warna kuning berarti menunjukkan semangat peserta didik sebagai generasi muda dalam menuntut ilmu pengetahuan yang bermanfaat bagi nusa danbangsa.                                                                                                                                                                              2. Jumlah delapan cabang bunga sebelah kiri dan lima cabang bunga sebelah kanan menunjukkan tahun berdiri  SMA N 1 Jakenan, yaitu 1985.                                                                                                                                                                                                  

4. Kata IMTAILA berarti : Iman, Taqwa, Ilmu dan Amal
5. Warna dasar biru menunjukkan dedikasi tinggi seluruh komponen sekolah dalam menyelenggarakan aktifitas proses pembelajaran, demi meraih masa depan yang lebih cerah.
6. Bingkai segi lima logo memiliki makna bahwa pancasila merupakan landasan filosofis SMA N 1 Jakenan dalam merealisasikan tujuan pendidikan yang diinginkan